99久久99久久精品免费看蜜桃,亚洲国产成人精品青青草原,少妇被粗大的猛烈进出va视频,精品国产不卡一区二区三区,人人人妻人人澡人人爽欧美一区

首頁 > 文章中心 > 正文

智能化抗酸桿菌檢測在結(jié)核診斷中應(yīng)用

前言:本站為你精心整理了智能化抗酸桿菌檢測在結(jié)核診斷中應(yīng)用范文,希望能為你的創(chuàng)作提供參考價值,我們的客服老師可以幫助你提供個性化的參考范文,歡迎咨詢。

智能化抗酸桿菌檢測在結(jié)核診斷中應(yīng)用

摘要:目的探討智能化抗酸桿菌檢測結(jié)核病理診斷中的應(yīng)用。方法收集150例肉芽腫性改變的石蠟包埋組織,同時進行手工抗酸染色和自動抗酸染色,分別進行人工閱片病理診斷。使用自主開發(fā)的結(jié)核桿菌識別人工智能(tuberculosisbacillusfinder,TBFinder)作為初篩,另請病理醫(yī)師復(fù)核150張自動抗酸染色切片并作出病理診斷,分析兩種染色模式的效率及準(zhǔn)確率。結(jié)果150例智能化平臺染色的陽性率為293%(44/150),傳統(tǒng)模式染色的陽性率為66%(10/150)。染色加診斷全流程智能化平臺每張切片耗時12min,傳統(tǒng)模式每張切片耗時57min,智能化平臺節(jié)約時間成本約78%。結(jié)論智能化抗酸桿菌檢測平臺的應(yīng)用可提高病理醫(yī)師的工作效率和診斷準(zhǔn)確率,有助于規(guī)范質(zhì)量控制。

關(guān)鍵詞:結(jié)核;抗酸染色;病理診斷;智能化;傳統(tǒng)

結(jié)核病是結(jié)核桿菌感染導(dǎo)致的慢性傳染病,我國結(jié)核病病例數(shù)居全球前列,其防治工作是醫(yī)療人員的重要任務(wù)[1]。結(jié)核病的治愈率和疫情的有效控制需具有及時和準(zhǔn)確的診斷,檢測結(jié)核桿菌的手段多種多樣,其中抗酸染色又稱為ZiehlNeelsen染色[2]。長期以來抗酸染色的操作和診斷均為人工完成,染色質(zhì)量難以保證,診斷不僅費時、費力,且陽性率低。近年隨著全自動染色機在病理科的應(yīng)用,抗酸染色切片質(zhì)量明顯提高,在一定程度上提高了病理醫(yī)師檢測陽性桿菌的工作效率,但其費時、費力的瓶頸仍未能得到突破。本實驗室自主研發(fā)CNN平臺的結(jié)核桿菌識別人工智能(tuberculosisbacillusfinder,TBFinder),作為抗酸染色病理檢測的初篩手段,在臨床試驗中具有高度敏感性和較高的特異性,為徹底解決結(jié)核桿菌抗酸染色病理診斷的難題提供強有力的工具[3]。本文將Benchmark全自動染色和TBFinder應(yīng)用于抗酸染色的病理診斷,創(chuàng)建智能化抗酸桿菌檢測模式,對比其與傳統(tǒng)抗酸桿菌檢測模式(手工染色+人工閱片)的實驗效率、染色質(zhì)量和診斷準(zhǔn)確率,探討智能化抗酸桿菌檢測在結(jié)核病理診斷中的價值及流程優(yōu)化。

1材料與方法

1.1材料

收集2019年7月~2020年7月北京大學(xué)第一醫(yī)院病理科診斷肉芽腫性病變的石蠟包埋標(biāo)本150例,常規(guī)45μm厚切片。每例均帶已確定抗酸陽性的對照組織,70℃烤片40min。本實驗經(jīng)北京大學(xué)第一醫(yī)院倫理委員會批準(zhǔn),患者均知情同意。

1.2儀器與試劑

1.2.1儀器。Benchmark自動染色機,Sukura封片機,標(biāo)簽打印機,Leica切片機,Leica水浴,Leica烤片臺,3DHISTECH掃描儀。1.2.2試劑。堿性復(fù)紅,無水乙醇,石碳酸,亞甲基藍(lán),1%鹽酸乙醇,蘇木精,Depar脫蠟液,LCS液,Wash清洗液,蒸餾水等。

1.3實驗方法

1.3.1手工染色。操作步驟:(1)切片脫蠟至水;(2)入石碳酸復(fù)紅液1h,入37℃或56℃溫箱孵育30min;(3)蒸餾水洗凈;(4)05%鹽酸乙醇分化;(5)蒸餾水洗,用01%亞甲基藍(lán)水溶液復(fù)染10min;(6)蒸餾水洗,經(jīng)95%乙醇分化;(7)100%乙醇脫水,二甲苯透明,中性樹膠封固[3]。1.3.2Benchmark全自動染色。(1)檢查:開機后檢查機器是否運轉(zhuǎn)正常,查看緩沖試劑桶內(nèi)的試劑及廢液桶,確保有能夠完成當(dāng)次染色的液位;(2)備片:在電腦中選擇需要的染色項目方案,打印標(biāo)簽,貼于切片,制片并烘干;(3)運行:將玻片平放在染色托上,標(biāo)簽側(cè)朝外,組織朝上,確定四角鎖定好后關(guān)閉載片倉,將染色項目試劑放入試劑臺,打開試劑蓋,點擊“運行”,機器自動掃描每張玻片和試劑,電腦顯示工作狀態(tài)圖為黃色并出現(xiàn)倒計時,染色自動開始;(4)完成:工作狀態(tài)圖為綠色,取下玻片,運行清洗項目(圖1)。

1.4病理診斷

1.4.1人工診斷。由兩位病理醫(yī)師分別閱片、作出病理診斷;診斷一致的病例,記錄為最終診斷;診斷不一致的病例,共同閱片、討論、達(dá)成一致,作為該病例的最終診斷。1.4.2智能化診斷。采用TBFinder初篩+病理醫(yī)師復(fù)核的模式。(1)采用3DHISTECH掃描儀掃描抗酸染色切片,數(shù)字切片提交TBFinder。(2)TBFinder初篩采用兩階段模型設(shè)計,第一階段為目標(biāo)檢測階段,目的為識全切片圖像上的所有桿菌候選物,采用具備Stateoftheart性能的目標(biāo)檢測神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)RetinaNet基礎(chǔ)網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu),并加入可變卷積、Swish激活函數(shù)、半精度訓(xùn)練等優(yōu)化設(shè)計。采用包圍框標(biāo)注記錄桿菌在截圖上的頂點位置,最終模型在測試集上達(dá)到mAP@05=088。第二階段為分類階段,根據(jù)第一階段的檢測結(jié)果將整張切片分為陰性、陽性。從第一階段的檢測結(jié)果中選出置信度最高的10個桿菌候選物,將檢測框置信度、檢測框大小作為特征值輸入SVM模型。根據(jù)500例具有活檢診斷記錄的抗酸桿菌切片,其中200例原始診斷為桿菌陽性、300例診斷為陰性,采用6∶2∶2的數(shù)據(jù)拆分比例,模型在測試集上達(dá)敏感性100%和特異性76%。(3)病理醫(yī)師復(fù)核:TBFinder標(biāo)注的陽性桿菌,病理醫(yī)師對數(shù)字圖片進行復(fù)核,有疑問的病例在光鏡下進行驗證。(4)最終病理診斷:TBFinder初篩為陰性者為抗酸陰性;TBFinder初篩為陽性者,需經(jīng)病理醫(yī)師在數(shù)字切片或光鏡下確認(rèn),仍為陽性者為抗酸陽性(圖2),反之為抗酸陰性[4]。

1.5染色切片質(zhì)量評估

由兩位病理醫(yī)師分別對手工和自動染色切片進行質(zhì)量評分。評分標(biāo)椎:(1)整體顏色:顏色不一致1分,一致性好2分;(2)菌體顏色:淺紅色1分,紫紅色2分(陰性病例的評分參考陽性對照組織);(3)背景顏色:不著色1分,藍(lán)色2分;(4)脫片:部分脫片1分,無脫片2分;(5)污染:有雜質(zhì)1分,無雜質(zhì)2分。上述各項評分相加為總評分:5分為差,6~8分為良,9~10分為優(yōu)[5],取兩位醫(yī)師評分的平均值作為該切片的最終評分。

2結(jié)果

2.1抗酸檢測陽性率

150例樣本經(jīng)智能化檢測模式的陽性率為293%(44/150),傳統(tǒng)檢測模式的陽性率為66%(10/150)。2.2切片質(zhì)量評分手工染色150例,切片質(zhì)量評分5~10分,平均78分,優(yōu)98張,良45張,差7張,優(yōu)良率953%(優(yōu)653%、良30%)。自動染色150例,切片質(zhì)量評分7~10分,平均89分,優(yōu)112張,良38張,差0張,優(yōu)良率100%(優(yōu)747%、良253%);兩者差異有顯著性(P<005)。

2.3效率

(1)染色:手工染色全流程耗時約110min(含脫蠟),自動染色約48min,自動染色節(jié)約時間62min。手工染色,一次最多染4~8張,自動染色一次通量為20張。(2)診斷:人工閱片每張切片平均耗時30min,TBFinder則只需2min,另行切片掃描和人工復(fù)核,智能化系統(tǒng)每張切片平均耗時10min。(3)染色+診斷全流程:智能化平臺每張切片耗時12min,傳統(tǒng)模式每張切片耗時57min,智能化平臺節(jié)約時間成本約78%。

2.4人工閱片和TBFinder閱片的比較

150例機染切片,醫(yī)師人工閱片陽性21例。TBFinder閱片陽性54例,不一致病例33例,均為人工閱片陰性,TBFinder閱片陽性。

3討論

長期以來抗酸染色均為手工完成,存在不穩(wěn)定因素較多,對操作者的技術(shù)要求高,導(dǎo)致染色質(zhì)量難以控制。結(jié)核桿菌長度僅約4μm,直徑不足1μm,是影響結(jié)核病理診斷的主要因素[5-6]。因此,提高抗酸染色切片質(zhì)量,降低尋找陽性桿菌的難度,是提升抗酸染色在結(jié)核病理診斷中應(yīng)用價值的兩大要素。人工智能源于1956年美國召開的人工智能達(dá)特茅斯夏季研討會[7],CNN是近年發(fā)展的一種非常高效的人工智能,尤其在圖像識別領(lǐng)域取得驚人的突破,同時具備高效率、客觀穩(wěn)定、長時間高負(fù)荷工作等優(yōu)點。與復(fù)雜的組織細(xì)胞形態(tài)相比,結(jié)核桿菌形態(tài)簡單,識別難度小,將人工智能引入抗酸染色切片的初篩可提高檢出率。本課題組根據(jù)CNN平臺自主研發(fā)的結(jié)核桿菌識別人工智能TBFinder,作為抗酸染色病理檢測的初篩手段,具有高度敏感性和較高的特異性[4]。盡管人工智能在尋找抗酸桿菌的工作中具有顯著優(yōu)勢,但其適應(yīng)能力遠(yuǎn)不如病理醫(yī)師,因此一致性好、色彩鮮亮、對比度好的染色切片是其發(fā)揮強大工作能力的基礎(chǔ)。手工染色切片受多種不確定因素的影響,嚴(yán)重影響了人工智能的工作效率。Benchmark全自動染色機是由染色模塊、緩沖液模塊、廢液收集模塊于一體的統(tǒng)一機械化運行,從而確保染色環(huán)境的相對封閉,減少了人為和外界環(huán)境變化的干擾,同時恒量的液體滴加和標(biāo)準(zhǔn)化的機械操作,使每一次染色的濃度均能保持一致,最終保證了切片顏色的均勻性和一致性。本組150例石蠟樣本,每個樣本連續(xù)切片2張,平行進行手工抗酸染色和自動抗酸染色,自動染色組(平均分89分、優(yōu)良率100%)切片染色質(zhì)量評分高于手工染色組(平均78分、優(yōu)良率953%)。因此,與手工染色相比,自動染色更能匹配人工智能的應(yīng)用,順應(yīng)了人工智能時代病理發(fā)展的潮流。本組將Benchmark全自動染色和TBFinder整合應(yīng)用于抗酸染色的病理診斷,創(chuàng)建智能化抗酸桿菌檢測平臺,對比傳統(tǒng)抗酸桿菌檢測模式(手工染色+人工閱片),病理診斷陽性率明顯提高(智能化模式293%vs傳統(tǒng)模式660%),且染色過程節(jié)約了時間成本,TBFinder初篩又為病理醫(yī)師節(jié)約了大量閱片時間。本組結(jié)果顯示,染色加診斷全流程,智能化平臺比傳統(tǒng)模式節(jié)約時間成本約78%。先進技術(shù)的應(yīng)用極大提升了生產(chǎn)力,但卻并非完全替代人的作用。首先,在染色環(huán)節(jié),由于機器的工作是連續(xù)不間斷的,出現(xiàn)錯誤需從新開始,降低效率。因此,應(yīng)做好前期的準(zhǔn)備工作,尤其是標(biāo)簽準(zhǔn)備、廢液桶及試劑瓶液位、染色試劑的剩余完成次數(shù)等關(guān)鍵環(huán)節(jié)需操作人員重點關(guān)注。為保證機器穩(wěn)定、高效的運行,經(jīng)常維護,定期清洗,注意試劑pH值的把控,嚴(yán)格規(guī)范操作等細(xì)節(jié)都是必不可少的。其次,自動化雖然降低了人的勞動強度,提高了工作效率,但制作優(yōu)質(zhì)的抗酸染色切片仍需實驗人員具備高度的責(zé)任心和精益求精的工作作風(fēng)。最后,病理診斷必須由病理醫(yī)師完成。本實驗人工閱片和TBFinder判讀結(jié)果不一致者33例(22%),將其病例的TBFinder標(biāo)注圖像由病理醫(yī)師復(fù)核,其中23例為真陽性,不一致的原因是人工閱片漏診所致;其中10例TBFinder找到的陽性菌不在肉芽組織和壞死中,被醫(yī)師判為非致病菌,屬于假陽性。由此可見,在實際應(yīng)用中病理醫(yī)師應(yīng)認(rèn)識到TBFinder的局限性,尤其是無法鑒別致病菌和非致病菌。因此,TBFinder的檢測結(jié)果必須經(jīng)病理醫(yī)師復(fù)核確認(rèn)后,才能作出抗酸染色陽性的診斷。綜上所述,由自動染色、人工智能組成的智能化抗酸桿菌檢測平臺,不僅提高了工作效率,降低勞動強度,減少漏診率,提高結(jié)核的檢出率,還有助于規(guī)范質(zhì)量控制和減少環(huán)境污染,使抗酸染色在結(jié)核診斷中發(fā)揮重要作用,值得臨床推廣。

作者:趙業(yè) 張凱聞 梁麗 熊焰 李挺 單位:北京大學(xué)第一醫(yī)院病理科